宏基因组检测服务
金识原全血介绍
- 分类:宏基因组病原检测服务
- 发布时间:2021-09-16 15:41:38
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目前绝大部分的血液mNGS检测产品主要是针对血浆层中的病原游离核酸(cfDNA)进行检测,该方案存在很多优点,如无需破壁、非侵入性取样、高灵敏度等1,然而依旧面临一些挑战。
一方面,部分低病原载量的血液样本,血浆层中的病原游离核酸含量较低,导致病原检测限上调,灵敏度下降2; 另一方面,由于其未对血细胞层中可能存在的病原颗粒进行检测,可能会导致一定比例的病原颗粒漏检,尤其针对胞内菌。
图1 cfDNA检测性能
金识原®血液全景版是金匙医学基于二代测序平台针对以上问题所开发的一款全新的血流感染宏基因组检测产品。
该产品在常规血液cfDNA检测产品的基础上,结合金匙医学自主研发的血细胞高效去宿主技术,同步对血浆层中存在的病原微生物游离核酸(cfDNA)、病毒颗粒,血细胞层中存在的完整微生物颗粒(包括细菌、真菌和少量病毒)及胞内菌进行检测,全景解析血流感染患者血液样本中病原微生物状态,辅助临床全面判断患者感染状态。
全景:同时检测血浆层cfDNA及血细胞层完整病原微生物颗粒,全景解析血液样本中病原微生物状态
自研:自主研发的血细胞高效去宿主技术,人源宿主核酸去除率高达99.9%
可靠:血浆cfDNA检测已通过中检院注册检并进入临床试验阶段
高阳性率:与血浆cfDNA检测相比,可提升5-10%的阳性率
血浆层:病原微生物游离核酸(cfDNA)、病毒颗粒
血细胞层:完整病原微生物颗粒(包括细菌、真菌和少量病毒)及胞内菌
怀疑原发性血流感染的患者
怀疑继发性血流感染的患者
不明原因发热待查患者
案例1:男性,52岁;临床诊断:白血病粒缺伴发热,院内培养结果:铜绿假单胞菌
金识原®血液全景版检测结果:
检测结果解析:部分血液cfDNA mNGS 检出结果与血培养检出结果不一致,可能为血浆层中的病原游离核酸含量较低或血细胞层病原漏网所致,通过金识原®血液全景版检测能够全景解析血液样本中病原微生物信息,判断病原是否入血的同时,进一步提高mNGS 结果与血培养结果的一致性。
案例2:男性,22岁,临床主诉:发热,气促4天;临床诊断:爆发性心肌炎
金识原®血液全景版检测结果:
检测结果解析:贝纳柯克斯体为专性胞内菌,血浆层cfDNA含量较少,血细胞层检测灵敏度更高,通过金识原®血液全景版检测能更好地解决常规血液样本胞内菌cfDNA难检问题。
参考文献:
1. Han D , Li R , Shi J , et al. Liquid biopsy for infectious diseases: A focus on microbial cell-free DNA sequencing[J]. Theranostics, 2020, 10(12):5501-5513.
2. Ebinger A , Fischer S , Hper D . A theoretical and generalized approach for the assessment of the sample-specific limit of detection for clinical metagenomics[J]. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2020, 19(10).
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