金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

从被识别到临床诊断,吸入性肺炎都经历了什么?

  • 分类:诊断案例
  • 作者:陈蒙蒙
  • 来源:金匙医学
  • 发布时间:2019-09-05 15:59
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【概要描述】吸入性肺炎是临床上常见的肺部炎症反应,发病多由于食物、口咽部分泌物、口腔寄殖菌及其他外源性异物等吸入至喉部和下呼吸道,这类通过咽口部吸入即可传播的炎症,临床上具有高发病率及高死亡率,但由于缺乏可靠的诊断标准,常被低估、误诊。

从被识别到临床诊断,吸入性肺炎都经历了什么?

【概要描述】吸入性肺炎是临床上常见的肺部炎症反应,发病多由于食物、口咽部分泌物、口腔寄殖菌及其他外源性异物等吸入至喉部和下呼吸道,这类通过咽口部吸入即可传播的炎症,临床上具有高发病率及高死亡率,但由于缺乏可靠的诊断标准,常被低估、误诊。

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  • 作者:陈蒙蒙
  • 来源:金匙医学
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      吸入性肺炎是临床上常见的肺部炎症反应,发病多由于食物、口咽部分泌物、口腔寄殖菌及其他外源性异物等吸入至喉部和下呼吸道,这类通过咽口部吸入即可传播的炎症,临床上具有高发病率及高死亡率,但由于缺乏可靠的诊断标准,常被低估、误诊。既往将肺炎分为社区获得性肺炎(CAP)、医院获得性肺炎(HAP)或呼吸相关肺炎(VAP)。据估计,吸入性因素在社区获得性肺占5-15%, 那么,吸入性肺炎是有什么临床表现又是怎么治疗的呢?

 

 

 

 

 01 吸入性肺炎临床表现 

 

 

 

 

      吸入性肺炎的临床症状从轻微到严重不等,这取决于感染的细菌或病毒类型、患者年龄和整体健康状况等因素,通常表现为发热、寒战、嗜睡、呼吸或咳嗽时胸痛、有时会咳出黄色、绿色粘液痰甚至痰中由血丝、老年人会出现精神意识混乱、体温降低、或其他类似与流感的症状。严重时会出现极度呼吸困难,吸气不足,需要大口呼吸,甚至会因为缺氧导致嘴唇指甲发紫,同时也会造成多种并发症。其中常见的就是菌血症,细菌会从肺部进入血液,将感染传播到其他器官进而引起器官的衰竭。如果肺炎没有得到及时的医治,就可能导致胸腔膜内的液体增多或肺脓肿,如胸腔积液被感染,则需要通过胸管或手术将积液排出。

 

吸入性肺炎典型胸部X线片

 

(来源:Medscape)

 

 

 

 

 

 02 吸入性肺炎常见病原菌 

 

 


 

 

     按照病因可讲肺炎分为细菌性肺炎、病毒性肺炎、支原体肺炎、真菌性肺炎 、衣原体肺炎、立克次体肺炎、寄生虫肺炎及其他放射性肺炎,化学性肺炎,过敏性肺炎等。细菌性吸入性肺炎是最常见的病因之一,即咽部寄植菌等吸入肺内,其严重时可发生肺脓肿。2007年美国感染性疾病协会(ISDA)/胸科学会社区获得性肺炎诊疗指南中指出,吸入性肺炎的主要病原体是G-肠杆菌和厌氧菌。

 

Ali A. El-Solh et al. Am J Respir Crit Care Med Vol 167.pp 1650-1654,2003

                                                           常见病原菌

1.CAP:肺炎链球菌,是典型的肺炎最常见的病因,可以从30%CAP病例的血培养中检出。除此之外还有SP消化球菌、SP消化链球菌、微需氧链球菌、产和色素杆菌、SP类菌、SP链球菌。

2.口咽部和肠道革兰氏阴性菌包括流感嗜血杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯峻、嗜麦芽窄食单胞菌、变形杆菌、阴沟肠杆菌和大肠杆菌。

 

 

                                                           主要致病菌


1.革兰氏阴性菌:大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌等肠杆菌科细菌

2.厌氧菌:脆弱类杆菌、消化链球菌、梭杆菌属

3.革兰氏阳性菌:金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、肠球菌属等

4.上述细菌的混合体。

此外,也可由于病毒、真菌(很少)等物质引起,一些引起感冒和流感的病毒会引起病毒性肺炎。

 

 

 

 

 

 03 吸入性肺炎的诊断方法 

 

 

 

 

治疗细菌性肺炎常用的方法是使用抗生素,并用退烧药、止痛药辅助治疗。病毒性肺炎通常以对症治疗为主。抗生素的选择取决于吸入场所(社区、医院或长期护理机构)和感染多重耐药菌、外科患者还是内科患者、是否接受过抗生素治疗等因素;抗生素使用不当,延迟抗生素治疗都是导致死亡率升高的危险因素,因此病原的准确诊断是临床治疗最为重要的步骤之一。

 

传统的诊断往往需要获得下呼吸道分泌物,从血培养或胸液培养中得到病原学资料的机会非常小。即使血培养阳性,致病菌也可来自肺外感染。对于ICU患者出现发热,怀疑有感染存在,但下呼吸道分泌物培养阴性(近期未更换过抗生素) ,通常提示VAP不存在,故要寻找其他的感染来源。同样,VAP患者如果某种耐药菌培养阴性,往往表明该菌不是真的致病菌。

 

很多实验室对于肺炎的病原学诊断,是通过痰或气道分泌物的半定量培养获得。痰涂片革兰染色直接镜检,通过仔细检查多型核白细胞及细菌形态。临床诊断的局限性可导致抗生素的过量使用,这与临床诊断敏感性过高有关。很多临床表现类似HAP的非感染性疾病,也可能接受抗生素治疗,如充血性心力衰竭(CHF) 、肺不张、肺栓塞、药物性肺损害、肺出血或ARDS。

 

传统方法对吸入性肺炎的检测需要同时结合实验室检查的结果和患者的临床症状,这类方法一方面可能存在漏查漏检的问题,另外一方面也很难鉴定新的病原体。基于宏基因组学的二代测序技术 (mNGS) 可以一次性检测诸如肺泡灌洗液、血液等临床样本中病原体的全部核酸序列,这种撒网捕鱼式的方法可将致病菌、环境菌、及罕见未知菌统统收入渔网,经由专家解读及临床信息24-48小时内确定病原体,针对病因完成临床的快速诊断。

 

 

 

 

          04 总结         

 

 

 

吸入性肺炎是临床非常重要的一种疾病,很难与其他吸入综合症相鉴别,为提高临床诊断的特异性, 病原宏基因组高通量检测方法应运而生,金识原产品,作为病原检测的先驱者,金识原检测可以涵盖13228种病原,不仅检测数量多,而且时效快,24-48小时即可出结果,最重要的是还拥有顶级的专家团队,团队成员涵盖了临床、微生物、mNGS等领域的优秀人才。

 

参考文献:

1.Mandell LA, Niederman MS.Aspiration Pneumonia.The New England journal of medicine.

2.LascarrouJB,LissondeF,LeThuaut,Aurélie,etal.AntibioticTherapy in Comatose Mechanically Ventilated Patients Following Aspiration[J]. Critical Care Medicine, 2017:1.

3.张怡, 朱鹏, 王彦琛. 老年吸入性肺炎患者病原菌感染特点及相关危险因素分析[J]. 中国微生态学杂志, 2017(09):83-86.

4.《哈里森感染病学》,主编Dennis L.Kasper, Anthony S.Fauci,主译胡必杰,潘钰,高晓东,上海科学技术出版社,2019.5

 

 

 

 

 

 

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