金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

金匙医学案例追踪二十三:用了激素,肺里竟长出了“虫” 弈秋 金匙医学 3天前

  • 分类:诊断案例
  • 作者:弈秋
  • 来源:
  • 发布时间:2020-09-22 20:51
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【概要描述】 患者女,83岁,发热3月,病情反复5天。取患者静脉血送检金匙医学进行mNGS检查,mNGS回报:耶氏肺孢子菌特异性序列5条;人疱疹病毒5型特异性序列7条,人类疱疹病毒4型特异性序列2条,人疱疹病毒1型特异性序列2条;人多瘤病毒1型特异性序列1条。

金匙医学案例追踪二十三:用了激素,肺里竟长出了“虫” 弈秋 金匙医学 3天前

【概要描述】 患者女,83岁,发热3月,病情反复5天。取患者静脉血送检金匙医学进行mNGS检查,mNGS回报:耶氏肺孢子菌特异性序列5条;人疱疹病毒5型特异性序列7条,人类疱疹病毒4型特异性序列2条,人疱疹病毒1型特异性序列2条;人多瘤病毒1型特异性序列1条。

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  1.病史及主诉

 

  主诉:发热3月,病情反复5天。

 

  患者女,83岁,3月前受凉后出现发热,体温最高38.5℃,伴有畏寒及右侧颌下淋巴结疼痛肿胀,诊断为成人Still病,给予“甲强龙40mgqd”治疗3天,减量至“甲强龙30mg qd”治疗4天,体温反复后再次给予“甲强龙40mg qd”治疗7天后,体温正常改为甲泼尼龙片(美卓乐) 36mg/日续贯治疗,此后激素逐渐减量,10天前减量至12mg/天。5天前再次受凉后出现发热,最高体温达38.5℃,每日上午体温逐渐升高达到顶点,午后热退,伴头痛,偶有胸闷憋气。查胸部CT:双肺见多发斑片状高密度影、多发条片状实变影,双肺炎症,血气提示I型呼吸衰竭,以“重症肺炎”收入院。既往无药物过敏史。

 

  2.入院检查

 

  T: 37.0℃ P:96 次/分 R:21次/分 BP:131/75 mmHg;血气分析 PH 7.5,PO2 46.1mmHg,PCO2 32.5mmHg,SpO2 86.4%(未吸氧),神志清,精神差,营养中等,焦虑,喘憋貌,口唇紫绀,扁桃体不大,口腔黏膜及咽后壁无破损及充血,胸廓无畸形,双侧呼吸运动对称,语颤无增强及减弱,双肺叩诊呈清音,双肺呼吸音粗,未闻及干湿性啰音。余未见异常。

  3.辅助检查

  (1).肺CT:

  患者6.18来诊影像资料

 

  (2).血气分析

 

  PH 7.5,PO2 46.1mmHg PCO2 32.5mmHg,SpO2 86.4%(未吸氧)。

 

  (3).血常规+CRP+血沉

 

  白细胞 7.39*10^9/L,中性粒细胞百分率84.60%,淋巴细胞百分率13.50%,单核细胞百分率1.80%,嗜酸性粒细胞百分率0.10%,红细胞3.71*10^12/L,血红蛋白113.00g/L;C反应蛋白75.69mg/L;血沉62.00mm/h。

 

  (4).淋巴细胞亚群

 

  辅助/诱导性T淋巴细胞15.41%,辅助/诱导性T淋巴细胞绝对计数0.04*10^9/L,NK细胞绝对计数0.05*10^9/L,抑制/杀伤性T淋巴细胞83.50%,辅助/诱导性T细胞11.35%,抑制/杀伤性T细胞61.50%,总T淋巴细胞绝对计数0.29*10^9/L,总淋巴细胞9.20%,总淋巴细胞绝对计数0.39*10^9/L,比值0.18。

 

  (5).病原学指标

 

  T-SPOT(-),乙型流感病毒抗体弱阳性(±),2019-nCoV核酸检测阴性(-)。

 

  (6).生化等指标

 

  B型钠尿肽126.00pg/ml铁蛋白1020.00ug/L;总胆固醇7.30mmol/L,低密度脂蛋白4.54mmol/L,葡萄糖3.22mmol/L,白蛋白29.82g/L,丙氨酸氨基转移酶47.78U/L。

 

  3.初步诊断

 

  1.成人斯蒂尔病 2.重症肺炎 3.I型呼吸衰竭 4.隐匿性冠状动脉粥样硬化性心脏病、不稳定性心绞痛、冠状动脉支架植入后状态、心功能Ⅱ级 5.脂肪肝 6.肝功能异常 7.2型糖尿病、糖尿病肾病 8.重度骨质疏松。

 

  4.鉴别诊断

 

  1.恶性肿瘤:白血病、淋巴瘤、恶性组织细胞病等血液系统肿瘤。

 

  2.感染性疾病:在感染性疾病中要特别注意败血症、组织器官的脓肿和某些病毒感染。病毒感染(乙型肝炎病毒、风疹病毒、微小病毒、柯萨奇病毒、EB病毒、巨细胞病毒、人类免疫缺陷病毒等),亚急性细菌性心内膜炎,脑膜炎双球菌菌血症,淋球菌菌血症及其他细菌引起的菌血症或败血症,结核病,莱姆病(Lyme病),布鲁杆菌病,梅毒和风湿热等。

 

  3.其他结缔组织病:RA、SLE、原发性SS、PM、混合性结缔组织病等,还有血管炎:如结节性多动脉炎、韦格纳肉芽肿病、血栓性血小板减少性紫癜、大动脉炎等。

 

  5.mNGS检查

 

  患者有呼吸衰竭,无法行支气管镜检查,而血培养等传统检查回报慢,为尽快明确病原,取患者静脉血送检金匙医学进行mNGS检查,48小时内mNGS回报:耶氏肺孢子菌特异性序列5条;人疱疹病毒5型特异性序列7条,人类疱疹病毒4型特异性序列2条,人疱疹病毒1型特异性序列2条;人多瘤病毒1型特异性序列1条。

 

  mNGS检测结果

 

 (1).病原诊断

 

  考虑患者双肺弥漫磨玻璃影,肺部阳性体征少,伴发热,呼吸窘迫,低氧血症,结合mNGS回报结果,诊断为肺孢子菌肺炎(pneumocystis cariniipneumnia, PCP)。

 

  肺孢子菌为单细胞生物,长期以来被划归为原虫,称为卡氏肺孢子(囊)虫。1988年通过对其核糖体小亚基rRNA的序列分析证实其属于真菌,更名为肺孢子菌,感染人类的被命名为耶氏肺孢子菌。PCP的潜伏期为4~8周。AIDS患者的潜伏期较长,平均为6周,甚至可达1年。起病缓慢,先有厌食、腹泻、低热,以后逐渐出现咳嗽,呼吸困难,症状呈进行性加重,未经治疗病死率为20%~50%。该病死亡率高,但早期治疗反应较好,多数可以得到恢复,故关键在于早期诊断和治疗。

 

  (2).后续治疗方案与结果

 

  复方磺胺甲噁唑 3片 tid po;卡泊芬净 50mgqd;更昔洛韦 250mg ivdrip q12h;甲强龙40mg ivdrip bid*3d,减量至40mg ivdrip qd*4d(针对抗GBM病,后期减量缓慢);左氧氟沙星0.5g ivdrip qd;其他支持治疗等。

 

  经治疗后,患者呼衰改善,体温正常,心率、血压平稳,病情逐渐痊愈。

 

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  关于金匙医学

 

  “金匙Genskey”取“基因钥匙”的含义,寓意企业以基因科技作为破解感染诊断难题的金钥匙。金匙医学的核心技术是感染病原高通量检测技术,为广大医疗工作者提供全面、准确、快速的病原微生物检测产品及服务。金匙医学研发中心坐落于北京中关村昌平生命科学园,是中关村高新企业,第三方医学检验所分别位于北京、天津、上海、广州,另在天津建有GMP车间,生产病原诊断医疗器械。

 

  金匙医学已获得数个I类,II类注册证,2项已授权发明专利,二十余项计算机软著。并与多家顶级临床院所深入合作,发表4篇高分SCI文章。在新型冠状病毒疫情期间,金匙医学联合四川大学华西医院开展SARS-Cov-2变异分析研究,并在国际病毒学权威杂志Journal ofVirology发表合作研究论文。

 

  金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、首都医科大学附属北京同仁医院、四川大学华西医院、中国医学科学院血液学研究所血液病医院、河南省肿瘤医院、陆道培医疗集团等顶级院所建立了深入合作关系,面向呼吸、血液、检验、重症、感染等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。

 

  金匙医学开发的“新型冠状病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗体检测试剂盒(胶体金法)”、“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(荧光PCR法)”和“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止法)”均已取得CE准入资格。2020年7月,金匙医学研发的病原微生物测序数据分析软件”成功获得医疗器械注册证,该软件提供包括细菌、支原体、衣原体、立克次氏体、螺旋体、病毒以及真菌的最全类别病原信息,将为临床感染性疾病的诊治提供重要且更为全面的参考。

 

  金匙医学已获得国家级科技型中小企业、天津市雏鹰企业、天津市战略性新兴产业领军企业等荣誉称号;在CHC医疗咨询联合中信证券在线发布的“2019年度中国医疗大健康产业投融资荣誉榜”中荣获“中国医疗健康产业最佳新锐奖”;在“2020年中关村国际前沿科技创新大赛”中荣登“病毒检测技术专场TOP10榜单”。

 

 

 

 

 

 

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