金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

金匙医学案例追踪三十一:迷雾重重,mNGS拨云见日显晴天

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  • 发布时间:2020-12-18 10:35
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【概要描述】患者李某,男,74岁 。入院时间:2020-04-20,入住耳鼻喉科。肺泡灌洗液行mNGS检测,肺泡灌洗液mNGS检测结果与痰培养的结果高度契合,结合患者病史、体征考虑多重耐药的鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌皆为致病菌,为混合感染,且存在耐药情况。调整抗感染方案,患者好转

金匙医学案例追踪三十一:迷雾重重,mNGS拨云见日显晴天

【概要描述】患者李某,男,74岁 。入院时间:2020-04-20,入住耳鼻喉科。肺泡灌洗液行mNGS检测,肺泡灌洗液mNGS检测结果与痰培养的结果高度契合,结合患者病史、体征考虑多重耐药的鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌皆为致病菌,为混合感染,且存在耐药情况。调整抗感染方案,患者好转

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  1. 病史及主诉

 

  患者李某,男,74岁 。入院时间:2020-04-20,入住耳鼻喉科。

 

  主 诉:摔伤致面部、左腕部疼痛3小时

 

  现病史:入院前3小时上楼时不慎摔倒,致面部疼痛,流血,伴头痛、头晕,伴恶心、呕吐,呕吐物为含有暗红色血液的胃内容物,左腕关节疼痛。

 

  既往史:“脑梗塞、脑出血”病史10余年,遗留言语不利、左下肢无力后遗症。“高血压、糖尿病”病史6年,血压、血糖未规范化治疗、管理。

 

  入院查体:神志清、精神差,言语欠流利。T36.8℃,HR99次/分,R16次/分, BP177/80mmHg。左侧颧弓处可见长约4cm伤口,深达骨质,活动性出血,中度污染,压痛阳性,左侧面部多处皮肤擦伤,左侧上下眼睑高度肿胀,眶周青紫肿胀。咽部可见陈旧性血性分泌物。

 

  辅助检查:WBC10.58x10^9/L,N 92.8%,L 3.6%,PLT 78x10^9/L。CRP<10mg/L,hsCRP<0.5mg/L。生化、凝血等大致正常。胸部CT示:双下肺间质增生伴炎症。头颅CT未见出血征象。

 

  2. 诊治经过

 

  4月21日患者出现烦躁不安,意识模糊,全身发抖,SPO2 80%-85%,HR130次/分左右,BP160/80mmHg左右。口腔可见较多的血性分泌物,双肺可闻及痰鸣音,双下肢可见皮肤花斑。考虑病情危重转入ICU治疗。急查血气示(FiO241%):pH 7.471, PCO226.3mmHg, PO2 44mmHg ,BE -5mmol/L ,lac 5.56mmol/L。APACHEII评分 24分。诊断:1.肺部感染 2.I型呼吸衰竭 3.面部挫裂伤 4.颌面多发骨折 5.左眼睑挫伤 6.左桡骨远端骨折 7.高血压病 8.脑出血后遗症期 9.多发腔隙性脑梗塞 10.2型糖尿病。行气管插管,呼吸机辅助呼吸,送检病原学标本。考虑患者存在误吸,经验性给予注射用哌拉西林钠他唑巴坦钠4.5g/q8h抗感染治疗后,患者神志清楚,体温恢复正常,复查血常规、血气恢复正常。于4月25日脱机拔除气管插管。拔管后,患者痰液较多。

 

  4月28日纤维支气管镜检查:气道内多处可见粘膜白斑。夜间体温39.9℃,给予氟康唑注射液抗真菌治疗。同时加用左氧氟沙星注射液0.4g /qd抗感染治疗后患者体温较前下降。

 

  5月5日再次间断出现发热,停用氟康唑、左氧氟沙星注射液,换用莫西沙星注射液250ml/qd抗感染治疗。

 

  5月10日痰液较前明显增加,黄色粘稠,痰涂片提示:大量G-菌。CRP13.5mg/L,hsCRP>10mg/L。血常规:WBC 22.95x10^9/L,N 94.2%,L 3%。调整抗感染方案为:莫西沙星注射液+头孢哌酮钠舒巴坦钠3g/q8h。

 

  5月11晚意识障碍程度较前加重,呼吸费力,血压80/50mmHg,血气提示II型呼吸衰竭,再次行气管插管呼吸机辅助呼吸,给予多巴胺、去甲肾上腺素稳定血压。

 

  5月12日血常规:WBC30x10^9/L,N95.2%,L 1.6%,PCT 1.67ug/L。痰培养回报:肺炎克雷伯杆菌,中量。

 

  5月15日送检的痰标本5月18日回报:鲍曼不动杆菌(多重耐药),菌落计数4+,大量;肺炎克雷伯菌,菌落计数4+,大量。且皆可见大量白细胞吞噬现象。

 

  5月15日送肺泡灌洗液行mNGS检测,5月18日检测结果报告:

 

  肺泡灌洗液mNGS检测结果与痰培养的结果高度契合,结合患者病史、体征考虑多重耐药的鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌皆为致病菌,为混合感染,且存在耐药情况。抗感染方案调整为:注射用硫酸多黏菌素B 100U/q12h+头孢哌酮钠舒巴坦钠3g/q6h。

 

  调整抗感染治疗方案后,患者精神较前明显好转,痰液较前减少。体温较前下降,脱机时间延长。感染指标较前下降。复查镜下痰标本:未检出鲍曼不动杆菌,可见极少量肺炎克雷伯菌。后成功脱机拔管,患者生命体征平稳,一般情况较前改善。

 

  3. 诊治体会

 

  mNGS为重症感染患者致病微生物的确定提供了重要依据,为临床诊疗方案的优化提供了有力的证据,提高了治疗的时效性和有效性。同时mNGS还检出OXA-73 和ADC-82耐药基因,对头孢菌素类、青霉烷等耐药,与临床培养结果鲍曼不动杆菌(多重耐药)高度一致,另外宏基因组测序还可以提示其他种类的细菌、病毒等参考信息(如本案例中肠球菌与之前培养结果也是高度一致),展示了宏基因组测序在临床诊断中“一网打尽”的优势。可以帮助医生快速、精准的找到致病菌,为临床的治疗提供有效的治疗帮助。

 

  在很多临床治疗的过程中,微生物室的培养技术、条件不同,导致对细菌、真菌等检出率不同,同时后续的药敏试验也有众多不确定因素,给临床病原菌的确定带来了不小的困惑。mNGS技术的使用可以弥补目前临床上众多传统技术的不足,目前已经成长为传统微生物检测手段的有力补充,今后一定会在临床工作中发挥重要作用。

 

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 关于金匙医学

 

  “金匙Genskey”取“基因钥匙”的含义,寓意企业以基因科技作为破解感染诊断难题的金钥匙。金匙医学的核心技术是感染病原高通量检测技术,为广大医疗工作者提供全面、准确、快速的病原微生物检测产品及服务。金匙医学研发中心坐落于北京中关村昌平生命科学园,是中关村高新企业,第三方医学检验所分别位于北京、天津、上海、广州,另在天津建有GMP车间,生产病原诊断医疗器械。

 

  金匙医学已获得数个I类,II类注册证,2项已授权发明专利,二十余项计算机软著。并与多家顶级临床院所深入合作,发表4篇高分SCI文章。在新型冠状病毒疫情期间,金匙医学联合四川大学华西医院开展SARS-Cov-2变异分析研究,并在国际病毒学权威杂志Journal ofVirology发表合作研究论文。

 

  金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、首都医科大学附属北京同仁医院、四川大学华西医院、中国医学科学院血液学研究所血液病医院、河南省肿瘤医院、陆道培医疗集团等顶级院所建立了深入合作关系,面向呼吸、血液、检验、重症、感染等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。

 

  金匙医学开发的“新型冠状病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗体检测试剂盒(胶体金法)”、“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(荧光PCR法)”和“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止法)”均已取得CE准入资格。2020年7月,金匙医学研发的病原微生物测序数据分析软件”成功获得医疗器械注册证,该软件提供包括细菌、支原体、衣原体、立克次氏体、螺旋体、病毒以及真菌的最全类别病原信息,将为临床感染性疾病的诊治提供重要且更为全面的参考。

 

  金匙医学已获得国家级科技型中小企业、天津市雏鹰企业、天津市战略性新兴产业领军企业等荣誉称号;在CHC医疗咨询联合中信证券在线发布的“2019年度中国医疗大健康产业投融资荣誉榜”中荣获“中国医疗健康产业最佳新锐奖”;在“2020年中关村国际前沿科技创新大赛”中荣登“病毒检测技术专场TOP10榜单”,同时在2020年荣获国家高新技术企业称号。

 

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