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【文献速递】mNGS在异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)患者中枢神经系统感染病原诊断中的应用

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【概要描述】异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)是一种治疗多种疾病的方法,如血液系统恶性肿瘤和一些非恶性疾病。中枢神经系统(CNS)感染是allo-HSCT受者的严重并发症,死亡率高。allo-HSCT后CNS感染的发生率差异很大,1.2%到15%不等。mNGS在诊断allo-HSCT后CNS感染方面的临床应用仍在讨论中。 本研究是一项前瞻性研究,使用mNGS与传统检测方法,研究allo-HSCT受者中

【文献速递】mNGS在异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)患者中枢神经系统感染病原诊断中的应用

【概要描述】异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)是一种治疗多种疾病的方法,如血液系统恶性肿瘤和一些非恶性疾病。中枢神经系统(CNS)感染是allo-HSCT受者的严重并发症,死亡率高。allo-HSCT后CNS感染的发生率差异很大,1.2%到15%不等。mNGS在诊断allo-HSCT后CNS感染方面的临床应用仍在讨论中。
本研究是一项前瞻性研究,使用mNGS与传统检测方法,研究allo-HSCT受者中

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题目:mNGS在异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)患者中枢神经系统感染病原诊断中的应用

发表杂志:《Bone Marrow Transplant》

发表时间:2021年4月

IF:4.725

作者:南方医科大学附属南方医院血液科

文章亮点:前瞻性研究allo-HSCT受者中CNS感染的病原学特征

 

研究背景

异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)是一种治疗多种疾病的方法,如血液系统恶性肿瘤和一些非恶性疾病。中枢神经系统(CNS)感染是allo-HSCT受者的严重并发症,死亡率高。allo-HSCT后CNS感染的发生率差异很大,1.2%到15%不等。mNGS在诊断allo-HSCT后CNS感染方面的临床应用仍在讨论中。

本研究是一项前瞻性研究,使用mNGS与传统检测方法,研究allo-HSCT受者中CNS感染的病原学特征,特别是检测病毒性能方面的差异

 

研究对象

      53例接受allo-HSCT治疗后的中枢神经系统疾病患者。男31例,女22例,平均年龄28岁(16-67岁)。原发病包括急性髓系白血病34例,急性淋巴细胞白血病11例,骨髓增生异常综合征4例,慢性粒细胞白血病2例,原发性骨髓纤维化2例。

 

研究结果

1. 脑脊液标本中病原体

53例患者中11例为非感染性病因, 7例病因尚不清楚,35例被诊断为中枢神经系统感染,其中28例病毒、2例细菌、1例真菌、3例混合感染,1例未知病原体。仅mNGS检出的病原体有HHV-7、HSV1、肺炎链球菌、猫立克次体和曲霉菌。

检测病原谱如下图:病毒是最常见的病原体。

注:中枢神经系统感染患者病原体谱

2. 病原体验证

针对仅由mNGS检测到的病原体进行进一步验证。病毒通过Sanger测序进行确认。细菌则通过抗菌治疗的效果来确定。在仅有的一例mNGS检测曲霉阳性的病例中,由于该患者未经抗感染治疗而康复,因此被认为是假阳性。mNGS和常规检测诊断移植后中枢神经系统感染的敏感性分别为97.1%和82.9%(P=0.106),特异性分别为94.4%和100.0%(P=1.000)。


3. 脑脊液和外周血中病毒差异

同时对中枢神经系统病毒感染患者的脑脊液和外周血标本进行DNA/RNA载量比较。4例患者脑脊液中检出病毒(HHV-6型2例,EBV-CNS感染型2例),外周血未检出病毒。

 

4. 中枢神经系统感染发病率

移植后CNS感染和CNS病毒感染的中位发病时间分别为54天(6~733天)和52天(6~733天)。移植后1年和2年的CNS累计感染率分别为5.51%(95%CI,3.83~7.61%)和6.59%(95%CI,4.65~8.96%)。移植后1年和2年CNS病毒累计感染率分别为4.45%(95%CI,2.96~6.38%)和5.29%(95%CI,3.57~7.48%)。

 

讨  论

关于allo-HSCT后CNS感染的病原谱,早期研究表明弓形虫和真菌是主要病原体,其次是曲霉、念珠菌和病毒。近几十年来,越来越多的研究表明病毒,尤其是疱疹病毒,是allo-HSCT后CNS感染的主要病原体。在目前的研究中,病毒是最常见病原体,其次是细菌和真菌。

关于病毒的种类,许多研究表明疱疹病毒最常见。本研究发现EBV是导致中枢神经系统病毒感染的主要原因,这与前人研究结果也一致。一些回顾性研究显示,HHV-6是最常见。一项回顾性研究表明,RSV是单倍体相合HSCT受者中枢神经系统病毒感染的最常见原因。对这些差异的合理解释是,在我们的研究中,EBV相关的CNS-PTLD被归类为中枢神经系统感染性疾病。

病毒血症对疱疹病毒相关疾病的诊断很重要,但在中枢神经系统感染中,脑脊液和外周血中病毒,特别是疱疹病毒的差异并不少见。在我们的研究中也观察到了这一现象。因此,对无病毒血症的患者不应排除中枢神经系统病毒感染。

 

结  论

      mNGS可能是诊断移植后中枢神经系统感染的一种有前景的技术。病毒是异基因造血干细胞移植受者中枢神经系统感染最常见的病原体。


 

关于金匙医学

 

金匙医学成立于2017年,坐落于北京昌平中关村生命科学园,公司不断深耕分子诊断技术在感染领域的应用。金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、四川大学华西医院、中国医学科学院血液学研究所血液病医院、陆道培医疗集团等顶级院所建立了深入合作关系,服务临床千余家,面向呼吸、血液、检验、重症、感染等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。 

 

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金匙医学是业内发布了基于二代测序和三代测序病原微生物高通量检测产品的企业,也是行业内实现进口和国产测序平台双双高分通过国家临检中心mNGS室间质评的企业。金匙医学是一家拥有直接针对临床样本进行宏基因组分子耐药表型预测产品的企业,金识原血流感染检测产品是同类产品中通过中国食品药品检定研究院注册检并进入临床试验的产品。 

 

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