匙事钥闻

资讯分类

NEJM:利用高通量测序有效预防感染爆发

  • 分类:行业资讯
  • 作者:任若通
  • 来源:金匙基因
  • 发布时间:2019-10-18 13:42
  • 访问量:

【概要描述】耳念珠菌(Candidaauris,C.auris)是一种新出现的多重耐药真菌病原体,通常存在于重症监护病房(ICU)1, 2,与近年来世界范围内的多次疫情爆发密切相关。2009年C.auris首次从一例日本患者的耳道中分离3。2011年C.auris被报道可导致严重的血液感染4。在欧洲,C.auris已经在英国,西班牙,挪威和德国被确认与临床感染密切相关5-7。2015年4月至2016年11月期

NEJM:利用高通量测序有效预防感染爆发

【概要描述】耳念珠菌(Candidaauris,C.auris)是一种新出现的多重耐药真菌病原体,通常存在于重症监护病房(ICU)1, 2,与近年来世界范围内的多次疫情爆发密切相关。2009年C.auris首次从一例日本患者的耳道中分离3。2011年C.auris被报道可导致严重的血液感染4。在欧洲,C.auris已经在英国,西班牙,挪威和德国被确认与临床感染密切相关5-7。2015年4月至2016年11月期

  • 分类:行业资讯
  • 作者:任若通
  • 来源:金匙基因
  • 发布时间:2019-10-18 13:42
  • 访问量:
详情

 

 

 

耳念珠菌(Candida auris,C. auris)是一种新出现的多重耐药真菌病原体,通常存在于重症监护病房(ICU),与近年来世界范围内的多次疫情爆发密切相关。2009年C. auris首次从一例日本患者的耳道中分离2011年C. auris被报道可导致严重的血液感染。在欧洲,C. auris已经在英国,西班牙,挪威和德国被确认与临床感染密切相关2015年4月至2016年11月期间,伦敦的心胸重症监护室曾发生过一次涉及72名患者C. auris疫情大爆发

 

 

 C. auris可导致ICU感染疫情爆发

 

近期,牛津大学医院的研究者们在新英格兰医学杂志上发表他们的最新研究Eyre DW, Sheppard AE, Madder H, et al. A Candida auris Outbreak andIts Control in an Intensive Care Setting. N Engl J Med. 2018;379(14):1322-1331),系统描述了C. auris定植的危险因素、定植时间、侵入性感染的发生率、暴发的分子流行病学以及所采取的感染控制措施。

 

2018年新英格兰医学杂志发表的C. auris流行病学研究论文研究人员调查了2015年2月至2017年8月期间约翰拉德克利夫医院神经科学ICU发生的大规模C. auris爆发情况,利用基于Illumin Miseq平台对患者鼻腔、腋窝、腹股沟、气管和外伤创口的拭子培养物以及尿液培养物等样本进行高通量测序分析,发现共有70例患者确诊感染C. auris,且有7例发展为侵入性C. auris重度感染,其中66例(94%)曾在神经科ICU接受治疗。进一步结合患者住院时间长短和生命体征,以及神经科ICU科室环境和医用器械等环境高通量测序结果,预测C. auris定殖或感染可能与可重复使用的皮肤表面腋窝温度计(多变量优势比,6.80;95%置信区间[CI]2.96~15.63;P<0.001)和全身氟康唑暴露(多变量优势比,10.34;95%可信区间,1.64~65.18;P=0.01)密切相关。

 

ICU暴露导致C. auris感染爆发

 

通过对患者来源样本和环境样本的高通量测序数据进行进化分析,发现本次神经科ICU相关的C. auris感染爆发中所有样本来源的C. auris基因组序列均与南非C. auris同源,并形成单一的遗传群集进化枝。同时,从腋窝温度计等可重复使用设备上分离出的C. auris序列与患者来源序列高度同源,表明C. auris这种新出现的病原体可以持续存在于环境中,并在卫生保健机构中传播。

 

神经科ICU感染爆发的C. auris 与南非C. auris高度同源

 

“我们发现在一般环境中很少检测到念珠菌,16个空气样本中只有1个是阳性的,”研究论文的第一作者David Eyre博士解释说: “然而,我们在患者使用的可重复使用器械上找到了念珠菌,尤其是温度计。因此,我们这项研究清楚地表明,念珠菌能够在医疗保健环境中持续存在和传播。“同时,David Eyre博士还认为:“研究C. auris的传播机制将有助于控制其在世界范围内的传播,而我们的研究有助于阻断念珠菌疫情的爆发。”NIHR牛津大学生物医学研究中心的英国公共卫生国家感染服务主任Derrick Crook教授认为:“这项研究将直接纳入有关可重复使用器械和多用途设备使用的医疗指南,尤其是在未来爆发的情况下需要对该类型设备进行有效净化。“

 

参考资料:

1. Chowdhary A, Sharma C, Meis JF. Candida auris:A rapidly emerging cause of hospital-acquiredmultidrug-resistant fungal infections globally. PLoS Pathog. 2017;13(5):e1006290

2. Chowdhary A, Voss A, Meis JF. Multidrug-resistant Candida auris:'new kid on the block' in hospital-associated infections?. J Hosp Infect. 2016;94(3):209-212

3. Satoh K, Makimura K, Hasumi Y, Nishiyama Y, Uchida K, Yamaguchi H.Candida auris sp. nov.,a novel ascomycetous yeast isolated from theexternal ear canal of an inpatient in a Japanese hospital. Microbiol Immunol.2009;53(1):41-4

4. Lee WG, Shin JH, Uh Y, et al. First three reported cases of nosocomialfungemia caused byCandidaauris. J Clin Microbiol. 2011;49(9):3139-42

5. Lockhart SR, Etienne KA, Vallabhaneni S, et al. Simultaneous Emergenceof Multidrug-Resistant Candida auris on 3 Continents Confirmed by WholeGenomeSequencing and EpidemiologicalAnalyses. Clin Infect Dis. 2017;64(2):134-140

6. Borman AM, Szekely A, Johnson EM. Isolates of the emerging pathogenCandida auris present inthe UK have several geographic origins. Med Mycol.2017;55(5):563-567

7. Ruiz Gaitán AC, Moret A, López Hontangas JL, et al. Nosocomial fungemiaby Candidaauris: First four reported cases in continental Europe. Rev Iberoam Micol. 2017;34(1):23-27

8. Larkin E, Hager C, Chandra J, et al. The Emerging Pathogen Candida auris:GrowthPhenotype, Virulence Factors, Activity of Antifungals, and Effect of SCY-078,a Novel Glucan SynthesisInhibitor, on Growth Morphology and Biofilm Formation.Antimicrob Agents Chemother. 2017;61(5)

9. Schelenz S, Hagen F, Rhodes JL, et al. First hospital outbreak of the globallyemerging <i>Candidaauris</i> in a European hospital. Antimicrob Resist Infect Control. 2016

10. Eyre DW, Sheppard AE, Madder H, et al. A Candida auris Outbreak and Its Controlin an IntensiveCare Setting. N Engl J Med. 2018;379(14):1322-1331

 

关键词:

扫二维码用手机看

CONTACT INFORMATION

联系方式

金匙北京:北京市昌平生命园创新大厦A202

金匙天津:天津市武清区创业总部基地B21栋

金匙上海:上海市嘉定区翔云科技园2栋1层

金匙广州:广州市黄埔区开源大道11号企业加速器C5栋2楼

咨询电话:400-0618-001

邮箱: genskey@genskey.com

金匙医学科技有限公司. All Rights Reserved. 

京ICP备19000364号-1 网站建设:中企动力北京

OFFICIAL ACCOUNTS

公众号

公众号二维码

ONLINE MESSAGE

联系方式

意向说明

联系信息

基本信息
联系方式与职位
企业信息
验证码