金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

金匙医学案例追踪三:揪出不明原因重症脑炎的“罪魁祸首”!

  • 分类:诊断案例
  • 作者:小徐
  • 来源:
  • 发布时间:2020-03-28 07:53
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【概要描述】金识原®️从一位27岁女性的脑脊液样本中检出伪狂犬病毒/猪疱疹病毒1型(Pseudorabies Virus,PRV),检出序列数64条,基因覆盖度4.9%。

金匙医学案例追踪三:揪出不明原因重症脑炎的“罪魁祸首”!

【概要描述】金识原®️从一位27岁女性的脑脊液样本中检出伪狂犬病毒/猪疱疹病毒1型(Pseudorabies Virus,PRV),检出序列数64条,基因覆盖度4.9%。

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金识原®️从一位27岁女性的脑脊液样本中检出伪狂犬病毒/猪疱疹病毒1型(Pseudorabies Virus,PRV),检出序列数64条,基因覆盖度4.9%。

图示:核酸序列在伪狂犬病毒基因组上的位置

由“犬”病毒引起的病毒病

伪狂犬病毒又称猪疱疹病毒I型,为双链DNA病毒,属于疱疹病毒科中的a疱疹病毒亚科[1]。同样属于a疱疹病毒亚科单纯疱疹病毒I、II和水痘带状疱疹病毒是人类神经系统病毒感染的重要病原。而猪是PRV主要自然宿主和传染来源[2],PRV对猪具有嗜神经性,可由神经突触后向突触前神经元逆行侵染神经系统。由于临床症状类似狂犬病得名伪狂犬病。

伪狂犬病病毒粒子呈椭圆形或圆形,其基因组为线性dsDNA分子,分子量为87×106 (约150kb),(G+C)mol%含量为73%,二十面体立体对称。位于细胞核内无包膜的病毒粒子直径约110~150nm,位于细胞质内带包膜的成熟病毒粒子的直径约150~180nm。包膜表面有呈放射状排列的刺突,其长度约8~10nm。

 

伪狂犬病毒脑炎

PRV对人类的致病性正逐步被研究所确认。1987年Mravak等报道三例血清抗体阳性的疑似PRV感染病例,三位患者来自于欧洲不同的地区,在密切接触猫后出现1-3周的前驱症状,继而出现自限性的多颅神经受累的表现,没有典型的脑炎症状,也未采用病毒核酸检测证实,单纯血清学阳性不排除为既往感染或者较差反应。而近期华山医院、西京医院等团队也应用NGS的方法揭示了PRV对人的致病性。华山医院感染科张文宏团队发现了PRV引起眼内炎的病例,并应用NGS技术在患者的玻璃体液中检测到了PRV,并通过PCR和血清学检测证实[3]
 
伪狂犬病毒脑炎(Pseudorabies encephalitis, PRE)临床特点
1、患者主要为从事生猪与生猪肉生产、加工与销售的人员;
2、急性起病,病前数日可有发热、头痛和感冒样症状的前驱期;
3、以迅速进展的重症脑炎多见,表现为癫痫发作,意识障碍,常需要ICU救治,甚至呼吸机辅助呼吸;
4、其他系统受累:视网膜炎等。
 
 
伪狂犬病毒脑炎(Pseudorabies encephalitis, PRE)的神经学影像表现为大脑灰质受累为主的坏死性脑炎,受累部位包括边缘系统、基底节区与脑干。
 
mNGS助力快速确诊伪狂犬病毒感染
由于伪狂犬病毒脑炎临床以重症脑炎多见,且一般为急性起病,因而患者早期快速确诊极为重要。2019年赵伟丽[4]等在《中华医学杂志》发表“伪狂犬病毒脑炎临床观察与脑脊液二代测序鉴定”的临床研究。该研究提示伪狂犬病毒是人类脑炎的病因之一。对于不明原因的脑炎病例,如果流行病学、临床表现、脑脊液以及影像学符合PRE,应尽快完善PRE核酸检测以及血清学检测。脑脊液mNGS有助于从不明病因脑炎中筛查PRV等新发病毒脑炎。

 

参考文献:

1.Pomeranz L E , Reynolds A E , Hengartner C J .Molecular biology of pseudorabies virus: impact on neurovirology and veterinarymedicine.[J]. Microbiology & Molecular Biology Reviews Mmbr, 2005, 69(3):462.
2. 黄骏明,朱庆虎. 猪伪狂犬病流行情况调查[J]. 中国预防兽医学报,1996(4): :33-35.
3.Ai JW, Weng SS, Cheng Q, et al., HumanEndophthalmitis caused by Pseudorabies Virus Infection [J]. Emerg Infec Dis,2018.
4. 赵伟丽, 乌依罕, 李红芳, 等. 伪狂犬病毒脑炎临床观察与脑脊液二代测序鉴定 [J] . 中华医学杂志, 2018, 98( 15 ): 1152-1157.

 

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“金匙Genskey”取“基因钥匙”的含义,寓意企业以基因科技作为破解感染诊断难题的金钥匙。金匙医学研发中心坐落于北京中关村昌平生命科学园,是中关村高新企业,第三方医学检验所分别位于天津、上海,另在天津建有GMP车间,生产病原诊断医疗器械。金匙医学的核心技术是感染病原高通量检测技术,为广大医疗工作者提供全面、准确、快速的病原微生物检测产品及服务。

金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、四川大学华西医院等顶级医院建立了深入合作关系,面向呼吸、血液、检验等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。

 

 

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