金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

金匙医学案例追踪十一:”缠斗千年”的结核分枝杆菌

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  • 发布时间:2020-04-18 15:35
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【概要描述】 金识原®️从一69岁男性患者肺泡灌洗液中检出结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)特异性序列10条,疑与临床患者肺部感染有关。

金匙医学案例追踪十一:”缠斗千年”的结核分枝杆菌

【概要描述】 金识原®️从一69岁男性患者肺泡灌洗液中检出结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)特异性序列10条,疑与临床患者肺部感染有关。

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  金识原®️从一69岁男性患者肺泡灌洗液中检出结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)特异性序列10条,疑与临床患者肺部感染有关。

 

  图:结核分枝杆菌基因组覆盖图

 

  “不死不灭的肺痨”

 

  1882年3月24日,德国细菌学家科赫(Robert Koch,1843-1910)宣布他发现了导致结核病的病原体,彼时的结核分枝杆菌被命名为Tuberkelvirus,次年才正式更名为结核分枝杆菌。分离的第一株菌株至今仍收藏在英国皇家科学院,而3月24日也被命名为“世界防治结核病日”。

 

  结核病,又称为“肺痨”,对于人类来说既陌生又熟悉,鲁迅,肖邦,林徽因,雪莱这些名人一度让结核病名声在外,根据中国疾控中心的数据,中国每年结核病的发病人数在86万左右,是当下国内“谈疫色变”COVID-19确诊人数的十倍左右。

 

  病原特点

 

  结核分枝杆菌,菌体细长,稍弯曲,两端钝圆,大小为(0.2-0.5)um。革兰染色不易着色,抗酸染色呈红色。以痰液直接涂片,结核分枝杆菌多为单个存在,有时呈现V、Y、人字形排列,痰液菌量多时可排列为束状或者集聚成团。

 

  图结核分枝杆菌纯培养的镜下形态(抗酸染色)以及痰标本直接涂片(抗酸染色)

 

  结核分枝杆菌具有超强的感染能力,患者咳嗽,打喷嚏,大声说话,其中包含细菌的微小液滴也会随之喷出,附着在空气中的悬浮颗粒中生存数小时,或随着呼吸道飞沫被他人吸入。结核分枝杆菌感染最主要的特点是“欺软怕硬”。当人体的免疫力强的时候,那它自动进入休眠状态,潜伏以待时机;当人体免疫力下降的时候,病原就会扩散至其他的人体器官。据保守估计,目前全球的结核潜伏感染者高达25%,活动性的结核患者或许仅仅是感染患者的“冰山一角”。

 

  主要临床症状

 

  人对结核分枝杆菌具有较高的易感性,临床主要以病原菌通过飞沫传播进入呼吸道引起的肺结核最为常见:肺结核临床主要症状为连续咳嗽、咳痰2周以上,或痰中带有血丝。同时还可能伴有胸痛、盗汗、午后低热、全身疲乏、食欲减退等其他常见的症状。

 

  此外,部分患者结核分枝杆菌可进入血液循环引起肺内、外播散,如脑、肾结核,痰菌被嚥入消化道也可引起肠结核、结核性腹膜炎等。

 

  临床诊断“金标准”

 

  分枝杆菌的培养以及鉴定是诊断的“金标准”,但是结核分枝杆菌生长及其缓慢(其最快分裂增殖速度为18小时一代,作为对比,大肠杆菌约需20分钟便可繁殖一代),一般需要2-4周才能有结果,这也导致临床难以对患者进行快速精准的诊疗。

 

  mNGS辅助临床快速精准诊断

 

  2019年9月3日,南方医科大学南方医院胡亚芳教授和北京协和医院关鸿志教授团队联合在《Frontiers in Microbiology》(IF:4.259)上发表了关于mNGS在结核性脑膜炎病原学鉴定中的可行性研究成果,该研究结果为致残致死率高但早期诊断困难的结核性脑膜炎提供了一种新的诊疗方向与方法。

 

表:目前结核性脑膜炎不同检测方法对比

 

  研究显示传统的方法诊断结核性脑膜炎的阳性率低于40%,且目前很多的治疗没有病原学依据。mNGS凭借其高敏感性、无偏移性、广覆盖、高效率的特点为临床疑难危重、特殊感染、混合感染患者的病原鉴定提供了一种新的诊疗思路,促进感染性疾病的精准诊疗。

 

 参考文献:

 

  1. 周庭银主编.临床微生物学诊断与图解:上海科学技术出版社,2012.05:157-161.
  2. Wang S, Chen Y, Wang D, Wu Y,Zhao D, Zhang J, XieH, Gong Y, Sun R, Nie X, Jiang H, Zhang J, Li W, Liu G, Li X, Huang K, Huang Y,Li Y, Guan H, Pan S and Hu Y (2019) The Feasibility of MetagenomicNext-Generation Sequencing to Identify Pathogens Causing Tuberculous Meningitisin Cerebrospinal Fluid. Front. Microbiol. 10:1993.

 

 

  关于金匙医学

 

  “金匙Genskey”取“基因钥匙”的含义,寓意企业以基因科技作为破解感染诊断难题的金钥匙。金匙医学研发中心坐落于北京中关村昌平生命科学园,是中关村高新企业,第三方医学检验所分别位于天津、上海,另在天津建有GMP车间,生产病原诊断医疗器械。金匙医学的核心技术是感染病原高通量检测技术,为广大医疗工作者提供全面、准确、快速的病原微生物检测产品及服务。金匙医学已获得数个I类,II类注册证,2项已授权发明专利,二十余项计算机软著。

 

  金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、四川大学华西医院等顶级医学院所建立了深入合作关系,面向呼吸、血液、重症、感染、检验等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。

 

 

 

 

 

 

 

 

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