金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

金匙医学案例追踪十三:免疫抑制患者的“致命杀手”!

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  • 来源:
  • 发布时间:2020-06-28 14:01
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【概要描述】王某某,63岁,女性,退休,已婚。3天前出现发热,最高体温39.5℃,胸闷、憋气明显,咳嗽,咳少量白粘痰,乏力,入急诊就诊,胸部CT示双肺多发磨玻璃影、斑片影,血气提示I型呼吸衰竭,呼吸科以“重症肺炎”收入。

金匙医学案例追踪十三:免疫抑制患者的“致命杀手”!

【概要描述】王某某,63岁,女性,退休,已婚。3天前出现发热,最高体温39.5℃,胸闷、憋气明显,咳嗽,咳少量白粘痰,乏力,入急诊就诊,胸部CT示双肺多发磨玻璃影、斑片影,血气提示I型呼吸衰竭,呼吸科以“重症肺炎”收入。

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  病史及主诉:

 

  王某某,63岁,女性,退休,已婚。3天前出现发热,最高体温39.5℃,胸闷、憋气明显,咳嗽,咳少量白粘痰,乏力,入急诊就诊,胸部CT示双肺多发磨玻璃影、斑片影,血气提示I型呼吸衰竭,呼吸科以“重症肺炎”收入。

 

  抗GBM病、急性肾衰病史3月。自01.13-02.27予“甲强龙500mg qd”冲击3天,血浆置换7次,环磷酰胺治疗,出院后泼尼松40mg qd,3.13减量为36mgpo qd至今。备注:患者头孢菌素、青霉素过敏。

 

  主诉:发热、胸闷、憋气3天。

 

  入院检查:

 

  T:39.4℃;P:128次/分;R:32次/分;BP:106/72mmHg;SpO2 88%(面罩吸氧5L/min);神志清,精神差,营养中等,焦虑,喘憋貌。口唇紫绀,扁桃体不大,口腔黏膜及咽后壁(-)。

 

  听诊双肺呼吸音粗,未闻及干湿性啰音。余系统查体无特殊。

 

  图患者入院胸部CT

 

  辅助检查:

 

  1. 呼衰严重:I型呼衰,乳酸 2.3mmol/L;

 

  2. 血清病原学实验:

 

  T-SPOT(-)

 

  G试验↑

 

  GM试验↑

 

  呼吸道病原体抗体(-)

 

  CMV IgG、HSVIgG阳性;

 

  3. 炎症指标升高:

 

  CRP 198.20mg/L

 

  ESR114mm/h

 

  WBC正常

 

  NEU↑,LYM 0.22*10^9/L,CD4+T淋巴细胞百分比:34.8%。

 

  4. 其他检查:肌酐 208μmol/L,尿蛋白升高,LDH 439U/L,抗GBM抗体:正常范围。

 

  初步诊断:

 

  重症肺炎:肺孢子菌肺炎?病毒性肺炎?抗GBM病?I型呼吸衰竭?低蛋白血症?电解质紊乱?

 

  病例特点总结:

 

 

  鉴别诊断:

 

  1. 孢子菌肺炎:由耶氏肺孢子菌引起,主要发生于免疫功能低下人群,特别是外周血CD4+T淋巴细胞<200个/μL者,是AIDS最常见的机会性感染。胸部CT:双肺弥漫性磨玻璃改变,由肺门向外带扩展。G阳性,LDH升高,低氧血症。

 

  2. 病毒性肺炎:免疫缺陷、低下病人常可出现病毒感染,多以巨细胞病毒、单纯疱疹病毒感染为主,主要症状为发热及呼吸困难,胸部CT以间质性改变为主,部分有结节状改变。

 

  3. 肺出血肾炎综合征:主要特征是肺出血、肾小球肾炎、抗GBM抗体阳性。胸部影像学主要表现为双侧弥漫性对称性肺门周围浸润影,肺及肋膈角不受累。本综合征发作时,90%以上抗GBM抗体阳性,且滴度与肾或肺病变严重性贫血。

 

  mNGS检查

 

  为尽快明确病原,临床取患者静脉血送检金匙医学进行mNGS检查,一天后mNGS回报:耶氏肺孢子菌特异性序列35条;人单纯疱疹病毒1型特异性序列987条;人疱疹病毒5型特异性序列34条;细环病毒16型特异性序列2条。

 

 

  病原诊断:

 

  考虑患者双肺弥漫磨玻璃影,肺部阳性体征少,伴发热,紫绀,呼吸窘迫,低氧血症,LDH升高以及mNGS回报结果,诊断为肺孢子菌肺炎(pneumocystiscarinii pneumnia, PCP)。

 

  后续治疗方案与结果:

 

  复方磺胺甲噁唑3片 q12h po(肌酐清除率调整);更昔洛韦 150mgivdrip qd(肌酐清除率调整);甲强龙 40mg ivdrip q12*5d,减量至40mg ivdrip qd*5d(针对抗GBM病,后期减量缓慢);美罗培南 0.5g ivdrip q12h、莫西沙星 0.4givdrip qd(mNGS回报后停用);其他支持治疗等。

 

  经治疗后,患者呼衰改善,体温正常,心率、血压平稳,肌酐下降,LDH进行性下降。

 

  图患者治疗期间体温记录单

 

  图患者治疗后胸部影像学

 

  知识小课堂

 

  耶氏肺孢子菌肺炎的病原体肺孢子菌是1909年由意大利人Antonio Carinii发现,并于1910年首次被定义为卡氏肺孢子虫(Pneumocystis carinii)。然而,由于该病原菌具备真菌与原虫两种特性,对其的分类存在很大的争议。一直到1988年,根据基因序列及表达产物分析将其归类为真菌。现已明确卡氏肺孢子菌(Pneumocystiscarinii)仅感染啮齿动物,耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jirovecii)是特指感染人类的肺孢子菌。

 

  耶氏肺孢子肺炎常见于免疫力低下患者,如血液病等。1990-1999年期间所报告的55例血液恶性肿瘤伴发PCP患者中,典型临床表现包括:急性发热(86%)、呼吸困难(78%)、干咳(71%)和严重低氧血症(71%),而胸痛(14%)和寒战(5%)则相对少见。

 

  mNGS为疑难危重感染患者病原检测提供新的思路

 

  “多药时代”下的精准治疗——尤其对于疑难、罕见、危重症感染病人及特殊感染人群(孕妇、免疫缺陷)等,宏基因组二代测序技术mNGS早期病原学检测是精准治疗的基石,进一步推动临床感染性疾病的精准诊疗。

 

 

  关于金匙医学

 

  “金匙Genskey”取“基因钥匙”的含义,寓意企业以基因科技作为破解感染诊断难题的金钥匙。金匙医学研发中心坐落于北京中关村昌平生命科学园,是中关村高新企业,第三方医学检验所分别位于天津、上海,另在天津建有GMP车间,生产病原诊断医疗器械。金匙医学的核心技术是感染病原高通量检测技术,为广大医疗工作者提供全面、准确、快速的病原微生物检测产品及服务。金匙医学已获得数个I类,II类注册证,2项已授权发明专利,二十余项计算机软著。

 

  金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、四川大学华西医院等顶级医学院所建立了深入合作关系,面向呼吸、血液、重症、检验等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。

 

  在新型冠状病毒疫情期间,金匙医学联合四川大学华西医院开展SARS-Cov-2变异分析研究,并在国际病毒学权威杂志Journal of Virology发表合作研究论文。同时,金匙医学开发的“新型冠状病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗体检测试剂盒(胶体金法)”、“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(荧光PCR法)”和“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止法)”均已经取得CE准入资格。金匙医学共计四个产品通过CE认证,分别涵盖二代测序、PCR、胶体金三种技术平台,满足各种临床检测和科研需求,为全球疫情防控贡献重要力量。

 

 

 

 

 

 

 

 

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