金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

金匙医学案例追踪十四:患者感染迷雾重重,mNGS一锤定音!

  • 分类:诊断案例
  • 作者:
  • 来源:
  • 发布时间:2020-06-28 14:23
  • 访问量:

【概要描述】临床取肺泡灌洗液/血液双样本送至金匙医学进行mNGS检测,一天后回报结果。肺泡灌洗液回报:黑曲霉特异性序列7条,人疱疹病毒5型特异性序列6条,细环病毒22型特异性序列1条;人单纯疱疹病毒1型特异性序列1条;血液回报:黑曲霉特异性序列2条,人疱疹病毒5型特异性序列22条,细环病毒16型特异性序列2条。

金匙医学案例追踪十四:患者感染迷雾重重,mNGS一锤定音!

【概要描述】临床取肺泡灌洗液/血液双样本送至金匙医学进行mNGS检测,一天后回报结果。肺泡灌洗液回报:黑曲霉特异性序列7条,人疱疹病毒5型特异性序列6条,细环病毒22型特异性序列1条;人单纯疱疹病毒1型特异性序列1条;血液回报:黑曲霉特异性序列2条,人疱疹病毒5型特异性序列22条,细环病毒16型特异性序列2条。

  • 分类:诊断案例
  • 作者:
  • 来源:
  • 发布时间:2020-06-28 14:23
  • 访问量:
详情

 

  病史及主诉:

  患者郭某,男,60岁,退休。2周前出现痰中带血,鲜红色,量较少,每日5-6口,间断发热,以低热为主,最高37.7℃,伴胸闷、憋气,不伴畏寒、寒战,无黄脓痰,无胸痛,无心慌、喘憋,无盗汗、消瘦,无鼻塞、咽痛等,于外院查血常规示白细胞及中性粒细胞计数正常,ESR123mm/h,给予抗炎止咳等对症支持治疗,效果欠佳,2天前咯血加重,每日咯鲜血约20ml。于我院急诊完善胸部CT示左肺下叶新发结节、右肺斑片影,给予止血、抗感染等治疗。

 

  患者201706因右肺肺癌行手术治疗,2019-12因常规复查提示行CEA37ug/L,行PET-CT考虑肺癌骨转移,规律口服凯美纳靶向药物治疗,后监测CEA明显下降至正常。

 

  个人史、婚育史、家族史无特殊。

 

  主诉:发热伴咯血2周。

 

  院内检查:

 

  查体:

 

  T:37.2℃;P:102次/分;R:20次/分;BP107 / 69mmHg;身高:170m;体重:46kg;神志清,精神可,颈部未触及肿大淋巴结,右肺呼吸音低,双肺未闻及明显干湿性啰音,心律齐,各瓣膜未闻及病理性杂音,腹软,无压痛及反跳痛,双下肢无水肿。

 

  辅助检查:

 

  1、胸部CT(2020/3/22):左肺下叶新发结节;右肺斑片影;双肺间质纤维化,右侧胸膜增厚,少量胸腔积液。

 

 

  2、生化检测(2020/4/1):总蛋白:86.6g/L↑;球蛋白:51.5g/L↑;尿酸:147μmol/L↓;钠:132mmol/L↓;氯:95mmol/L↓;

 

  3、血常规(2020/4/1): 白细胞计数:6.17×10^9/L;中性粒细胞百分率:72.20%;血红蛋白:93.00g/L↓;血小板计数:124.00×10^9/L↓超敏C反应蛋白:69.70mg/L↑;

 

  4、血气分析(2020/4/1):酸碱度:7.43;二氧化碳分压:40.00mmHg;氧分压:140.00mmHg↑;

 

  病例特点总结:

 

  1.慢性起病,急性加重,病情重

 

  2.合并肺癌病史

 

  入院诊断:

 

  1. 肺部感染:真菌感染?肺结核?

 

  2. 咯血

 

  3. 右肺癌并骨转移

 

  入院诊疗:

 

  血常规:WBC 4.42*109/L;NEU2.39*109/L,CRP:63.4mg/L,血沉:102mm/h,PCT:0.06ng/ml。

 

  肝肾功、电解质:无异常。

 

  TSPOT:阴性;呼吸道病原体检测:阴性;G、GM试验:阴性

 

  TORCH:巨细胞病毒IgG37.67 单纯疱疹病毒1 IgG 2.4

 

  淋巴细胞亚群:CD19+:3.09;CD3+CD4+/CD3+CD8+:0.56;CD3+CD8+ 46.74

 

  予以拜复乐 250ml Ivdrip qd;巴曲亭 1u Iv bid。

 

  院内检查结果迷雾重重:

 

  1. 感染性:真菌?结核?细菌?病毒?

 

  2. 非感染性:肺癌?无菌性炎症?

 

  肺泡灌洗液GM >5ug/L

 

  肺泡灌洗液培养:干燥奈瑟氏菌;革兰阴性杆菌少许,草绿色链球菌

 

  涂片查抗酸杆菌:未找到

 

  真菌涂片检查:未找到

 

  茫茫迷雾中,mNGS一锤定音:

 

  临床取肺泡灌洗液/血液双样本送至金匙医学进行mNGS检测,一天后回报结果:

 

  肺泡灌洗液回报:

 

  黑曲霉特异性序列7条,人疱疹病毒5型特异性序列6条,细环病毒22型特异性序列1条;人单纯疱疹病毒1型特异性序列1条;

 

 

  血液回报:

 

  黑曲霉特异性序列2条,人疱疹病毒5型特异性序列22条,细环病毒16型特异性序列2条;

 

 

  调整诊断:

 

  1.侵袭性肺曲霉病

 

  2.病毒性肺炎

 

  3.非获得性免疫功能缺陷

 

  4.右肺癌并骨转移

 

  调整治疗方案:

 

  1. 伏立康唑 200mgIvdrip q12h

 

  2. 更昔洛韦 200mg Ivdrip q12h

 

  3. 哌拉西林舒巴坦4.5g Ivdrip q8h

 

  4. 保肝、止血、化痰等对症治疗

 

  治疗结果:

 

  患者经过十余天的治疗,症状明显缓解,咳嗽减轻,低热,体温最高37℃,无咯血,无胸闷憋气。

 

图患者体温记录表

 

  复查血常规(20200515):WBC 4.42*109/L NEU2.39*19/L HB 98g/LC-反应蛋白(20200515):CRP 32.80mg/L患者的咳嗽、咳痰、喘憋等呼吸道症状持续好转,随访状态。

 

  总结

 

  本案例中,血液和肺泡灌洗液在院内常规的微生物检测都未得到有效信息,无法准确鉴定病原,通过mNGS一锤定音,两份检测结果都得到一致的病原信息(黑曲霉和CMV),为患者的治疗指明了方向。

 

  知识小课堂:

 

  黑曲霉(Aspergillus niger):曲霉属,黑曲霉组。是全球广泛分布的真菌,常见于土壤、植物、地下室等,常定植于呼吸道,是骨髓衰竭、实体器官移植、艾滋病患者的主要致病菌,也是实验室常见污染菌,可导致侵袭性肺病、耳鼻喉感染和脑膜炎等疾病,感染判定需要结合宿主状态、影像学和微生物学证据进行诊断。黑曲霉可以引起侵袭性感染,但更常见于呼吸道定植以及引起外耳炎。

 

  巨细胞病毒(CMV):在人群的感染极为普遍,常为隐性感染,仅少数人有临床表现。在机体免疫功能低下时易发生显性感染,感染后,多数认可长期带毒。人类是CMV的唯一宿主,现已被公认是各年龄组的重要病原体,CMV感染后,潜伏在人粒细胞内,一旦机体免疫力减弱,病毒就可能再读复制引起复发感染。

 

  关于金匙医学

 

  “金匙Genskey”取“基因钥匙”的含义,寓意企业以基因科技作为破解感染诊断难题的金钥匙。金匙医学研发中心坐落于北京中关村昌平生命科学园,是中关村高新企业,第三方医学检验所分别位于天津、上海,另在天津建有GMP车间,生产病原诊断医疗器械。金匙医学的核心技术是感染病原高通量检测技术,为广大医疗工作者提供全面、准确、快速的病原微生物检测产品及服务。金匙医学已获得数个I类,II类注册证,2项已授权发明专利,二十余项计算机软著。

 

  金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、四川大学华西医院等顶级医学院所建立了深入合作关系,面向呼吸、血液、重症、检验等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。

 

  在新型冠状病毒疫情期间,金匙医学联合四川大学华西医院开展SARS-Cov-2变异分析研究,并在国际病毒学权威杂志Journal of Virology发表合作研究论文。同时,金匙医学开发的“新型冠状病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗体检测试剂盒(胶体金法)”、“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(荧光PCR法)”和“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止法)”均已经取得CE准入资格。金匙医学共计四个产品通过CE认证,分别涵盖二代测序、PCR、胶体金三种技术平台,满足各种临床检测和科研需求,为全球疫情防控贡献重要力量。

 

 

 

 

 

 

 

 

关键词:

扫二维码用手机看

CONTACT INFORMATION

联系方式

金匙北京:北京市昌平生命园创新大厦A202

金匙天津:天津市武清区创业总部基地B21栋

金匙上海:上海市嘉定区翔云科技园2栋1层

金匙广州:广州市黄埔区开源大道11号企业加速器C5栋2楼

咨询电话:400-0618-001

邮箱: genskey@genskey.com

金匙医学科技有限公司. All Rights Reserved. 

京ICP备19000364号-1 网站建设:中企动力北京

OFFICIAL ACCOUNTS

公众号

公众号二维码

ONLINE MESSAGE

联系方式

意向说明

联系信息

基本信息
联系方式与职位
企业信息
验证码