金识原(GenseqPM)感染病原高通量检测

金匙医学案例追踪十五:恶性肿瘤化疗后混合感染,mNGS高效辨真凶!

【概要描述】本例患者因恶性淋巴瘤进行了为期4周的化疗,患者免疫功能明显减低,除肺孢子菌感染外也易合并其他病原体,患者使用mNGS检测在短期内发现肺孢子菌合并肺炎链球菌的感染,及时使用了对应的抗生素进行治疗,做到了早期发现、早期治疗,结果表明mNGS尤其适用于免疫力低下,缺陷的患者,因为他们更容易发生正常人中罕见的病原体感染。

金匙医学案例追踪十五:恶性肿瘤化疗后混合感染,mNGS高效辨真凶!

【概要描述】本例患者因恶性淋巴瘤进行了为期4周的化疗,患者免疫功能明显减低,除肺孢子菌感染外也易合并其他病原体,患者使用mNGS检测在短期内发现肺孢子菌合并肺炎链球菌的感染,及时使用了对应的抗生素进行治疗,做到了早期发现、早期治疗,结果表明mNGS尤其适用于免疫力低下,缺陷的患者,因为他们更容易发生正常人中罕见的病原体感染。

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  病史及主诉

 

  患者女性,65岁

 

  主诉:恶性淋巴瘤5月+,4 周期 R-CHOP 化疗后

 

  现病史:患者2019年11月无明显诱因出现烧心、进食阻挡感

 

  既往史:平素身体健康,否认高血压、否认糖尿病、否认冠心病,否认肝炎、结核等传染病史,2020年1月因贫血给予蔗糖铁,输注同型红细胞治疗。

 

  体格检查:T:35.7℃,P:76次/分 R:18次/分 BP:92/56mmHg

 

  肺部CT结果:

 

  1.双肺弥漫性磨玻璃密度,较前显著,不排除淋巴瘤浸润可能;双肺间质性改变;右肺上叶后段结节及斑片,部分较前新发,左肺下叶病变较前有所吸收;右肺中叶钙化灶。

 

  2.原诊胃淋巴瘤治疗后,胃底贲门部病灶较前边界清晰,体积略见效,胃底部结节样增厚,厚度较前增大,胆囊结石,较前新发。

 

  入院诊断

 

  1.弥漫性B细胞淋巴瘤(胃弥漫大B细胞淋巴瘤侵犯食管及腹腔淋巴结 IV B期)

 

  2.贫血

 

  入院后行支气管镜检查,同时肺泡灌洗液送检金匙医学进行高通量测序检查:一天后回报肺炎链球菌特异性序列28条,耶氏肺孢子菌12条。

 

 

  后续治疗与结果

 

  根据mNGS结果,治疗方案改为口服复方新诺明 2片/次 2次/日,莫西沙星 0.4g/次 1次/日,经治疗后患者偶有咳嗽,无胸闷,憋气,无发热,进食睡眠恢复,予以出院,肿瘤科门诊随访。

 

  治疗体会

 

  本例患者因恶性淋巴瘤进行了为期4周的化疗,患者免疫功能明显减低,除肺孢子菌感染外也易合并其他病原体,患者使用mNGS检测在短期内发现肺孢子菌合并肺炎链球菌的感染,及时使用了对应的抗生素进行治疗,做到了早期发现、早期治疗,结果表明mNGS尤其适用于免疫力低下,缺陷的患者,因为他们更容易发生正常人中罕见的病原体感染。

 

  知识小课堂:

 

  肺孢子菌肺炎(Pneumocystis pneumonia,PCP)是由耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jiroveci)引起的一种机会性感染,常见于人类免疫缺陷病毒(HIV)感染的患者。在非HIV感染者中,PCP一般发病更急,病情更严重,病死率大大高于HIV阳性的患者。临床研究表明,HIV感染者合并PCP病死率为10%~20%,而非HIV患者合并PCP病死率为30%~60%,其中,恶性肿瘤合并PCP患者死亡风险又高于其他病因的患者。随着肿瘤治疗技术的进步,更多更积极的治疗方法、新的抗肿瘤和免疫抑制药物的出现,肿瘤患者并发 PCP 的风险变得更高,而淋巴细胞减少、 长期住院治疗、放疗和强化化疗是恶性肿瘤合并 PCP 的危险因素,一项回顾性研究结果显示,103 例 HIV阴性的 PCP 患者中,实体肿瘤患者为 17.5% ,69%的患者曾接受细胞毒药物,55% 曾接受较长期糖皮质激素治疗,38% 患者死于 PCP。参考文献:1.叶宁, 朱明利, 李茜茜,等. 肺孢子菌肺炎实验室诊断研究进展[J]. 中国卫生检验杂志, 2017, 027(004):604-605,608.2.卢思奇. 肺孢子菌肺炎的病原检查和基因检测[J]. 诊断学理论与实践, 2010, 009(006):552-554.3.YiZ , Jing-Wen A , Peng C , et al. A cluster of cases of pneumocystis pneumoniaidentified by shotgun metagenomics approach[J]. Journal of Infection,2018:S0163445318302585-.

 

关于金匙医学

 

  “金匙Genskey”取“基因钥匙”的含义,寓意企业以基因科技作为破解感染诊断难题的金钥匙。金匙医学研发中心坐落于北京中关村昌平生命科学园,是中关村高新企业,第三方医学检验所分别位于天津、上海,另在天津建有GMP车间,生产病原诊断医疗器械。金匙医学的核心技术是感染病原高通量检测技术,为广大医疗工作者提供全面、准确、快速的病原微生物检测产品及服务。金匙医学已获得数个I类,II类注册证,2项已授权发明专利,二十余项计算机软著。

 

  金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、四川大学华西医院等顶级医学院所建立了深入合作关系,面向呼吸、血液、重症、检验等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。

 

  在新型冠状病毒疫情期间,金匙医学联合四川大学华西医院开展SARS-Cov-2变异分析研究,并在国际病毒学权威杂志Journal of Virology发表合作研究论文。同时,金匙医学开发的“新型冠状病毒(2019-nCoV)IgM/IgG抗体检测试剂盒(胶体金法)”、“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(荧光PCR法)”和“新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止法)”均已经取得CE准入资格。金匙医学共计四个产品通过CE认证,分别涵盖二代测序、PCR、胶体金三种技术平台,满足各种临床检测和科研需求,为全球疫情防控贡献重要力量。

 

 

 

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