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病原宏基因组产品系列用途都有哪些

发布时间:

2021/09/15 00:00

针对二代测序鉴定软件输出的结果中,目标病原丰度较高的场景,可直接采用流程,通过鉴定用的测序下机数据,获取目标病原的全基因组序列,无需重新进行建库。这个流程被整合在同一个分析系统中,极大方便了用户使用。

,创立了,凭借其多年医药行业经验及对于感染与免疫、微生态、微生物检测、临床病原检测应用的积累,不仅紧跟生物学技术潮流,还与多位人工智能领域中的知名专家学者开展深度合作,以促进其技术与产品进入数字化时代。

快速鉴别新发突发病原体,在疫情早期处理及预警方面具有重要的作用。SolarSystem内置多种病原鉴定生信分析流程,可利用二代和三代测序数据进行病原鉴定,实现二代高通量测序和三代单分子测序双平台数据分析的组合模式。此外,结合基因融合技术和双重比对算法,使单样鉴定流程从下机数据到病原物种鉴定结果,仅需1分钟,快速应对新发突发传染病疫情。

摘要:病原高通量测序技术理论上能够检测几乎所有病原体基因组核酸,且适用于几乎所有类型的临床样本,尤其适用于病原不明的疑难感染性疾病的诊断。因此该技术正逐渐成为实验室常规检测方法的重要补充和不可替代的项目。然而,基于该技术的诊断试剂不仅检测流程繁琐复杂、技术更新迭代速度较快,同时相关质量控制与评价的方法和标准也有待明确,这些因素均给该技术的临床转化应用、行业发展以及监管带来挑战和不确定性。文中简述了该技术的原理和优势,以及检测流程和关键质量控制环节,最后着重介绍了关于该技术的质量评价方法和标准的相关思考。

随着病原微生物二代测序技术、自身免疫脑炎抗体检测的发展,对各型脑炎的病因诊断有了飞速的变化。其中第二代测序能够非靶向地检测临床标本中的病原体核酸,在中枢神经系统感染性疾病的病原体诊断方面,已逐步应用于临床。

探因医学始终专注于病原微生物临床分子诊断产品研发和临床检测服务,其核心团队属国内较早一批进入病原体二代测序临床应用领域。

——目前已形成以临床病原高通量检测平台(病原测序,病原体靶向测序tNGS,新型纳米孔测序nanopore)为核心,结合病原PCR检测与质谱检测技术平台、免疫学检测技术平台、全自动化流水线微生物培养与药敏鉴定技术平台等,依托感科专家顾问团队,形成特色临床诊断路径,以临床患者诊疗需求为导向,为不同感染症候群体提供更快、更全、更准的一站式感染综合诊断服务。

病原捕获技术的临床应用:通过靶向富集技术解决临床样本高人源背景带来灵敏度不足的问题,通过多中心或单中心临床研究评估检测技术分析性能的提升和对患者预后改善的临床影响。建议所采用的富集技术应尽可能保留技术特征,能检测2000种以上的病原体。

   病原捕获技术的临床应用:通过靶向富集技术解决临床样本高人源背景带来灵敏度不足的问题,通过多中心或单中心临床研究评估检测技术分析性能的提升和对患者预后改善的临床影响。建议所采用的富集技术应尽可能保留技术特征,能检测2000种以上的病原体。

如今,联合医学通过整合PCR技术、靶向NGS技术和技术,已建立起病原体感染鉴定整体解决方案,方案主要包括新型冠状病毒核酸检测试剂盒系列产品并提供全组分冻干型检测试剂盒

脑脊液第二代测序对神经型布鲁菌病的诊断较脑脊液布鲁菌血清学检测和脑脊液培养更为敏感,对临床疑似神经型布鲁菌或不能确定病原体的神经系统感染患者行脑脊液第二代测序检查有利于明确诊断。

对于病原测序领域而言,检测准确性与时效性是该领域企业立足的根本。在此基础之上,自动化、数字化的解决方案或将为其提供新的发展思路。

结合临床实验室病原检测结果、临床诊断信息以及抗微生物治疗效果,优化病原在疑难危重感染中病原体检测的敏感性与特异性,提升感染精准诊断与临床干预能力。

在得到TBA结果的第一时间,感染科、、教授和神经内科教授结合患者临床特征,共同讨论这个患者的病情,并制定了新的治疗方案,即由原有的抗感染治疗转为激素冲击免疫治疗。值得注意的是我们在入院第一次腰穿送检脑炎相关抗体的同时送检了病原学测序,其检测结果提示病原学阴性,给了我们更大的信心诊断排除感染,诊断自身免疫性脑炎,也更有把握切换治疗方向。

随着二代测序技术的发展,病原()因其时效性高,通量高,阳性率高等特点,逐渐得到临床的认可和广泛应用。但在临床上,目前比较困惑的点在于,当得到的检测结果显示检出多种病原体时,非常难以判断应优先考虑哪种微生物。而当有病原体提示毒力因子检出时,可以帮助临床判断哪种病原体致病性更强,可以从多种病原检测结果中,筛选出更加可疑的病原,提高对临床辅助诊疗的提示性价值。因此,诺禾致源推出毒力因子全新升级后的病原PD-seqTM,全流程24小时交付,单样本数据量高达50M,高于同行的阳性检出率,可交付行业领先的耐药基因和毒力因子双检测结果。

纪以来,新发突发病原体引发的流行性疫情是公共安全的主要威胁,严重影响了全球健康可持续发展。特别是冠状病毒的频繁新发、流感病毒变异重组多发和环境中病原体的潜在暴发,让人们意识到全面建立病原学为基础的监测预警平台的重要性。基于对国内公卫领域的病原监测急切需要的了解,依托多年病原学技术及产品开发经验,结合开创性的变异检测加速算法、多维度病原分子分型数据库、以及新发病原预警模型等关键性分析技术,打造一款本地化、自动化、智能化的微生物基因组快速分析系统SolarSystem。

分子生物学检测方法:病原体检测技术(),该技术不需要培养即可直接检测临床标本,尤其是对一些病因不明的感染或已使用抗感染药物治疗后,仍有一定检测阳性率,为疑难、少见感染病的病原学诊断提供依据,然其结果解释和诊断价值评估需结合临床谨慎进行。

首席研究员、副教授博士说:

技术是通过对临床样本的所有DNA或RNA进行鸟枪法测序,可以无偏倚地同时检测多种病原微生物(包括病毒、细菌、真菌和寄生虫)。二代和三代测序平台均可用于该项技术。按从样本中提取的核酸类型不同可以分为测序和宏转录组测序。按照测序模式可以分为单端测序和双端测序[12]。随着技术的逐步推广,目前已逐渐实现临床样本不出「医院」或者不出「本地区」的本地化检测模式。

自2013年就开始布局基因测序领域,开发了肿瘤筛查、肿瘤个体化用药伴随诊断、病原微生物检测、无创产前筛查、慢病管理等一系列临床和科研检测服务项目。

据悉,自2013年就开始布局基因测序领域,开发了肿瘤筛查、肿瘤个体化用药伴随诊断、病原微生物检测、无创产前筛查、慢病管理等一系列临床和科研检测服务项目。

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