"匙"事求是(第51期): 分子耐药表型预测技术助力临床快速诊断耐药菌
耐药菌是全球面临的难题，特别是耐碳青霉烯肠杆菌科菌属（CRE）被列为美国三大噩梦般的病原体之一。二代测序被称为感染性疾病诊断的革命性技术之一，能早期检测出传统微生物不能检测的病原体，已将感染性疾病的早期诊断向前推动了一大步。 目前随着诊断技术的进步、耐药菌筛查和预防理念的提高、抗多重耐药菌新型药物的研发，对抗CRE治疗提供了很大帮助。但对病原菌是否耐药的早期预测，相信也是早期启动CRE治疗的关键
金识原®优秀案例2.0--《"匙"事求是》全新上线！
本栏目将定期邀请临床专家分享金识原®优秀案例及观点，从临床角度出发，聚焦mNGS在感染病原体检测的应用，助力mNGS更好服务于临床。
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专家点评
耐药菌是全球面临的难题，特别是耐碳青霉烯肠杆菌科菌属（CRE）被列为美国三大噩梦般的病原体之一。二代测序被称为感染性疾病诊断的革命性技术之一，能早期检测出传统微生物不能检测的病原体，已将感染性疾病的早期诊断向前推动了一大步。
目前随着诊断技术的进步、耐药菌筛查和预防理念的提高、抗多重耐药菌新型药物的研发，对抗CRE治疗提供了很大帮助。但对病原菌是否耐药的早期预测，相信也是早期启动CRE治疗的关键问题。本例病例早期通过mNGS检出耐药菌，并通过金匙医学独家的耐药表型预测方式预测该致病菌可能为耐碳青霉烯的病原体，在患者发生感染性休克时很快启动抗耐药菌治疗，后续院内传统培养也提示是耐碳青霉烯的肺炎克雷伯杆菌，与mNGS一致，休克迅速得到控制，预后良好。
但临床还经常遇到一种情形是，在使用抗生素后传统培养常常出现假阴性结果，此时患者仍然有或轻或重的感染体征或者病情波动，在没培养到阳性病原菌时，无法利用传统的药敏结果来预测是否有致病耐药菌存在，此时mNGS技术可能可以在某些情况下检测出致病菌并且预测其耐药表型。当然，目前通过mNGS技术预测耐药表型还处在摸索阶段，期待更多的与传统方法的验证数据来证实其预测方式的准确性，给临床提供多一种方式，从而改善耐药菌感染的预后。
关于金匙医学
金匙医学成立于2017年，坐落于北京昌平中关村生命科学园，公司不断深耕分子诊断技术在感染领域的应用。金匙医学与上海交通大学医学院附属瑞金医院、山东大学齐鲁医院、中国医学科学院血液学研究所血液病医院、郑州大学第一附属医院、陆道培医疗集团等知名院所建立了深入合作关系，服务临床千余家，面向呼吸、血液、检验、重症、感染等科室，提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。
金匙医学已完成四轮融资，母公司及子公司天津金匙于2020年双双取得国家高新技术企业证书认定，并于2019年和2020年蝉联清科集团评选的Venture 50最具投资价值企业，连年入选动脉网"中国创新医疗服务榜TOP100"，在2020年中关村国际前沿科技创新大赛中荣登"病毒检测技术TOP10榜单"，2021年获得北京市"专精特新"中小企业证书，2021年评为"天津市企业技术中心"。
金匙医学已发布基于二代测序和三代测序病原微生物高通量检测产品，实现了进口和国产测序平台并双双高分通过国家临检中心mNGS室间质评。并创新性推出直接针对临床样本进行宏基因组分子药敏表型预测的产品GenseqAMR。在血液样本领域，金匙医学已推出血浆及血细胞检测组合解决方案，其中，金识原®针对血浆层核酸检测已在国际检验学知名期刊《Clinical Chemistry》发表系统性临床研究性能验证文章，目前该产品已通过中检院注册检并进入NMPA三类注册临床研究。
金匙医学在北京、上海、广州、天津拥有自己的医学检验实验室，面积超过19000m2，在武汉、成都、西安等与当地医学实验室均有合作。此外，金匙医学协助郑州、深圳、南昌、济南、昆明、海口、南京等多家三甲医院实现院内开展病原基因检测项目。
金匙医学管理团队多位成员来自知名外资药企、硅谷著名临床诊断公司以及国内成功基因检测类公司的管理层，从业时间在二十年以上。公司现有员工500余人，企业90%以上人员为生命科学和临床医学背景，普遍在基因测序、医药、诊断企业，医疗机构和微生物研究机构工作多年。企业20%以上人员拥有博士学历，50%以上人员拥有硕士学历。
金匙医学已获得数个I类，II类注册证，4项已授权发明专利，50余项计算机软著，8个注册商标，并与多家顶级临床院所深入合作，发表20余篇高分SCI文章，其中共一和共通讯作者文章5篇。2020年7月，金匙医学研发的"病原微生物测序数据分析软件"成功获得医疗器械注册证。
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