研究主要基于SARS-CoV-2 S基因设计特异性引物构建了SARS-CoV-2的逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测体系,该体系仅需恒温60-65℃反应,无需大型PCR扩增设备。作者在两个前瞻性队列以及无症状携带者的不同类型样本中对RT-LAMP方法进行了临床验证,还采用其他呼吸道病毒感染患者和健康对照的鼻咽拭子测试RT-LAMP的特异性。同时采用常规的RT-qPCR进行对比检测,RT-q
前言
2020年8月,广东省人民医院联合华南理工大学、金匙医学在微生物权威杂志《mSphere》合作发表了题为"Development and clinical application of a rapid and sensitive loop-mediated isothermal amplification test for SARS-CoV-2 infection"的研究论文。
文章研发并大样本量验证了一种快速检测SARS-CoV-2的RT-LAMP方法。
本文作者
本研究论文通讯作者为广东省人民医院侯铁英教授、华南理工大学张雷教授,共同第一作者为胡雪姣、邓倩昀、李俊敏,广东省人民医院为该论文的第一作者单位。
主要方法及研究成果
研究主要基于SARS-CoV-2 S基因设计特异性引物构建了SARS-CoV-2的逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测体系,该体系仅需恒温60-65℃反应,无需大型PCR扩增设备。作者在两个前瞻性队列以及无症状携带者的不同类型样本中对RT-LAMP方法进行了临床验证,还采用其他呼吸道病毒感染患者和健康对照的鼻咽拭子测试RT-LAMP的特异性。同时采用常规的RT-qPCR进行对比检测,RT-qPCR和 RT-LAMP结果不一致的样本进一步采用基于多重PCR扩增技术的高通量测序方法(金匙医学检测)来确认样本的阴阳性。该高通量测序的方法由金匙医学公司自主设计开发,其通过171对扩增子对SARS-CoV-2的基因组序列进行了全覆盖,多重PCR产物完成测序文库构建后,在Illumina NextSeq 550测序平台进行双端150bp测序,对低病毒载量样本的检测更为准确和灵敏。
临床样本验证显示,在筛检SARS-CoV-2时,RT-LAMP显示出比RT-qPCR更高的敏感性(88.89% vs 81.48%),其与RT-qPCR的一致性较好(kappa 0.92),同时RT-LAMP具有操作简便、耗时短等优势,RT-LAMP有望作为不同级别医院和公共医疗机构对COVID-19的快速筛检手段。
关于金匙医学
金匙医学成立于2017年,坐落于北京昌平中关村生命科学园,公司不断深耕分子诊断技术在感染领域的应用。金匙医学与中日友好医院、北京大学人民医院、四川大学华西医院、中国医学科学院血液学研究所血液病医院、陆道培医疗集团等顶级院所建立了深入合作关系,服务临床千余家,面向呼吸、血液、检验、重症、感染等科室,提供病原微生物宏基因组诊断产品及检测服务的整体解决方案。
金匙医学北京和天津公司是国家高新技术企业,已获得国家级科技型中小企业、天津市雏鹰企业、天津市战略性新兴产业领军企业等荣誉称号;获评2020年中关村"病毒检测技术TOP10";连续两年蝉联清科集团评选的Venture 50最具投资价值企业,动脉网评选的未来医疗100强。
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